Para ir del aeropuerto al puerto para coger el ferry a Formentera hay autobuses, y bien puedes bajarte en cualquiera de las paradas que hace en la ciudad o bien puedes bajarte en cualquiera de las dos paradas que tiene en el puerto, una justo en los andenes de los ferries, y la otra unos 20 m.más allá del edificio de la estación marítima donde se compran los billetes para los ferries.
Para ir a Formentera hay varias navieras y a diferentes precios, el trayecto viene a durar poco más de media hora, en los ferries de trasmapi, que son los que llamamos lentos, o de unos veinte minutos en el ferry de balearia, aunque este es un poco más caro que los otros y sólo te ahorras unos diez minutos, a menos que encuentres alguna oferta yo cogería los otros.