Te paso el link de la compañía que lleva los vaporetos desde y hacia el aeropuerto:
www.alilaguna.it
Los vaporetos son caros y lentos. Yo le cogí de San Marco al aeropuerto y me costó 10 euros hace 2 años, ahora seguro que es más caro. Tardé una hora y media. Pero es un puntazo llegar al aeropuerto en barco.
Lo que te comentan del autobús. No sé cuánto cuesta ni cuánto tarda porque no lo cogí, pero te deja en el Piazzale Roma, al lado de la estación de tren de Santa Lucia y desde ahí te pillas el vaporeto por el Gran Canal hasta San Marco.